Die Überprüfung, ob die Standardanforderungen eingehalten werden, erfolgt in mehreren Schritten. Die beteiligten Baumwollgesellschaften müssen jedes Jahr Informationen zu Geschäftstätigkeiten sowie eine Selbsteinschätzung übermitteln, die Informationen über die baumwollbezogenen Geschäftstätigkeiten der vorangegangenen Saison sowie eine Selbsteinschätzung ihrer Einhaltung der geltenden Kriterien und Indikatoren enthält.
Dies dient der Aid by Trade Foundation zunächst als Grundlage für die externe Überprüfung durch unabhängige Prüfer und für die Überwachung der datenbezogenen Wirkungsindikatoren. Sowohl der Selbsteinschätzungsprozess als auch die anschließende unabhängige Überprüfung durch Dritte werden jährlich durchgeführt. Der Schwerpunkt des Überprüfungsprozesses liegt jedes Jahr abwechselnd auf den Baumwollfeldern und den Entkörnungsbetrieben.
Das CmiA-Zertifikat für eine Baumwollgesellschaft ist zwei Jahre gültig. Innerhalb dieser Laufzeit findet im ersten Jahr eine Überprüfung auf Ebene der Entkörnung und im zweiten Jahr eine Überprüfung auf Feldebene während der Anbauperiode statt. Sind beide erfolgreich absolviert, wird ein neues Zwei-Jahres-Zertifikat ausgestellt und der Prüfzyklus beginnt von vorne. Cotton made in Africa schreibt vor, dass diese Überprüfungen ausschließlich von unabhängigen und qualifizierten Dritten vorgenommen werden. Die Aid by Trade Foundation unterstützt die Baumwollgesellschaft dabei, einen Plan zur kontinuierlichen Verbesserung zu erstellen und legt konkrete Ziele fest, die bei der nächsten Überprüfung erreicht werden müssen.